于是在林肯入住白宫这前，南卡州故伎重演，宣布脱离美利坚合众国，此后一个多月的时间里，陆续又有六个州宣布脱离合众国，

很多代表南方奴隶主的政治家退出了国会。林肯得以顺利推行保护国家工业的关税政策。

1861年2月，南方奴隶州依据临时宪法建立政府，新政权以蒙哥马利为首都，推举杰斐逊·戴维斯为总统，美利坚联盟国正式成立。

1861年3月，林肯正式入驻白宫，在就职会场上宣布不承认南方政权，虽然无意侵略南方各州，将合众国将使用武力保障联邦在南方的物业所有权。

南卡州的查尔斯顿有一个萨姆特堡，它是是三个在联盟国范围内却仍然受联邦控制的要塞之一，而且林肯坚持要守住它。在联盟国总统杰佛逊·戴维斯的命令下，联盟军队在4月12日炮击要塞，迫使要塞投降。北方各州应林肯向各州的号召派遣部队重夺要塞及保护联邦。于是林肯在90天召集七万五千个志愿牛仔。

但是林肯的行动却引发另外四个州不满，又有四个州宣布脱离联邦，加入联盟国。

自此，南北双方的势力基本奠定，合众国和联盟国开始了长达四年的内战。

值得一提的是，在南方奴隶主的政治代表脱离国会后，林肯顺利的通过了关税保护议案和《宅地法》，这部近乎免费送地给成年人的宅地法给了南方奴隶主势力很大的打击。

再说明一下解放黑人奴隶跟南北战争的关联。

1862年9月，林肯发表了著名的《解放黑人奴隶宣言》，63年1月1日，又正式命令解放奴隶。虽然黑人们并没有因此得到政治权利，也没有得到土地。但“宣言”中表明林肯政府的态度已经从限制奴隶制转变为完全废除奴隶制，因此战争的目的从最初的维护国家统一放到新的基础上。

也许对联邦而言，将黑奴解放出来只是打击南方人的一种策略，但北方政权的作法却取得了十分显著的效果；首先，联邦政府利用这些被解放的黑奴生产和存备食粮、修复铁路、在农田与工场中作工、运输船只、挖矿、建筑防御工事以及从事看护工作和一般劳工。为了不使北方军队战败，让南方奴隶主的军队重新统治自己，黑人们非常卖力的替北方战争发动机加油。

同时为了激发联盟国内部黑奴们的不满，北方军队将数以百万份的《解放黑奴宣言》在联盟国占领的属地流传。希望这些地方的黑奴成为反抗联盟国的统治，动摇联盟国的基础。正如北方军所期望的一般，宣言透过口耳相传的方式迅速散播，并燃起人们对自由的希冀，造成联盟内部的混乱，以及鼓励许多黑奴起身脱逃。

看起来南北战争与黑人解放关系密切，但实际上也仅止于此，因为战后黑人的地位并没有得到多大改善，密西西比州州议会甚至一直坚持到1995年才接受联邦宪法第十三条修正案。美利坚合众国宪法第十三条修正案的内容旨在废除奴隶制和强制劳役，除非是犯了罪要接受劳改。换句话说，在1995年以前，密西西比州还在坚持奴隶制；可见美利坚的人权问题堪忧。