第一部队：中距离联合军分队（主力为擅长暗器和武器的忍者）。

统领：达鲁伊。成员：天天、秋道丁座、日向日足、萨姆伊、阿茨伊、钢子铁、神月出云等。

第二部队：近战联合军分队（负责斩杀数量多的敌人，在最前线战斗的队伍）。

统领：黑土。已知成员：黄土、日向宁次、卡鲁伊、日向雏田等。

第三部队：战斗近中距离联合军分队（负责持久战。）

统领：旗木卡卡西，成员：迈特凯、春野樱、李洛克、山中三田、奈良盐水、真树等。

第四部队：远距离战斗联合军分队（同时负责支援前线及后方的部队）

统领：第五代风影·我爱罗，成员：手鞠、秋道丁次、土代等。

第五部队：战斗特别部队（全为武士或使用特殊忍术、战斗方法的忍者们组成的部队）

统领：三船，成员：油女志乃、犬冢牙、山中井野、犬冢爪、犬冢花等。

医疗后勤部队（负责救助伤员）

统领：静音，成员：春野樱、白善等。

感知部队（负责感知敌人方位）

统领：希

这些作战部队的指挥分配上，五大忍村基本算是雨露均沾，倒也没有产生太大的矛盾。

不过在争夺首脑的领导层位置时，几个忍村的影，倒是吵得有些不可开交。

虽然忍者联军的结构，已经注定了总指挥无法偏私于任意忍村。

但这次的忍界大战，不管是规模还是意义，明显都是忍界有史以来最大的。

谁能进行指挥作战，并且最终胜利，不管是对个人还是对忍村，好处自然都是极大的，所以五影自然会进行争夺。

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